基于分子对接技术的G蛋白偶联受体GPR18药靶结构研究开题报告

 2023-04-18 01:34:47

1. 研究目的与意义(文献综述包含参考文献)

一、论文研究的目的及意义生物机体在进行生命活动时是通过一系列复杂而精确的信号网络来维持内环境的稳态并协调各细胞组织的代谢活动的,而该信号网络主要是通过细胞间的化学信号物质传递而引发的信号转导实现的。

细胞膜上存在着多种可以感受各类信号的蛋白受体,其中G蛋白偶联受体(G protein coupled receptors,GPCRs)是人体内最大的膜受体蛋白家族,具有保守的7次跨膜螺旋结构,在细胞信号转导中发挥关键作用。

GPCR可识别细胞外的各种信号分子,如激素、神经递质、离子、光、气味分子等,与之结合后发生构象改变,随后与细胞内的效应蛋白(包括G蛋白、GPCR激酶GRK和阻遏蛋白)相互作用,从而诱导各种细胞反应。

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2. 研究的基本内容、问题解决措施及方案

本课题研究拟聚焦于人体重大疾病相关的G蛋白偶联受体GPR18,开展基于分子对接的计算生物学、网格药理学研究,探讨GPR18配体识别的分子机制,为实验验证GPR18的结构以及靶向GPR18的药物设计提供理论基础。

本课题拟采用Alphafold2与Rosettafold等蛋白结构预测软件,进行结构预测、可信度分析等工作;完成配体筛选、三维结构获取等操作;完成蛋白活性口袋预测、确定备用口袋;完成GPR18与备选配体的分子对接;并使用Pymol、VMD、Ligplus 等蛋白可视化分析软件分析实验结果、制作图表;撰写论文。

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