1. 研究目的与意义
背景:黑色素瘤发展迅速,容易转移,临床预后差,仅在早期可以通过切除手术较好治愈,晚期的黑色素瘤对放疗和化疗反应较差,因此发展到后期的黑色素瘤相当致命。近十年来靶向治疗和免疫治疗的发展极大地改善了中晚期黑色素瘤患者的预后,但耐药性影响力进一步的治疗。 CSN是细胞内高度保守的多亚基蛋白质复合物,主要定位于真核细胞的细胞核。CSN复合物作为蛋白泛素化降解系统中重要的调控蛋白,其功能的紊乱会导致多种疾病的发生。CSN复合物含有8个亚基,它是泛素蛋白酶体系中重要的调控蛋白,调控Cullin蛋白的deneddylation进而调控体内蛋白的降解,体内20%的蛋白降解由Cullin蛋白家族调控。体内蛋白降解失衡会导致肿瘤的发生发展,在细胞内CSN7亚基有两个亚型CSN7A和CSN7B,这两个亚型的复合物对肿瘤的发生发展目前研究较少,因此本课题主要探究CSN7复合物在黑色素瘤中的作用机制。
目的:通过对生信数据库的分析,明确CSN7A和CSN7B在癌和癌旁组织的表达情况以及患者生存预后情况,探究CSN7A和CSN7B复合物对黑色素瘤发生发展的作用机制。
2. 研究内容和预期目标
1)通过GEPIA数据库,明确CSN复合物的不同亚型在不同癌种中的表达情况,明确CSN不同复合物在不同癌种中的表达差异,筛选出有明显差异的癌种进一步明确其作用机制。
(2)通过ULACAN数据库分析,明确CSN复合物的不同亚型在肿瘤不同时期,不同性别,不同人种以及不同年龄中的差别,确定CSN复合物的不同亚型在黑色素瘤中的功能。
(3)通过人类蛋白质图谱免疫组化分析,明确CSN复合物的不同亚型在黑色素瘤的癌组织和癌旁组织中的表达水平。
3. 研究的方法与步骤
通过数据库的数据进行分析,下面是本文拟采用的数据库
1、GEPIA数据库
4. 参考文献
[1] Schadendorf D, van Akkooi ACJ, Berking C,et al. Melanoma[J]. Lancet,2018, 392(10151): 971-984. [2] Puig Sard S. New Dermatological Insightsin Melanoma Diagnosis and Treatment[J]. Actas dermo-sifiliograficas, 2017,108(1): 1-2. [3] Macdonald JB, Dueck AC, Gray RJ, et al.Malignant melanoma in the elderly: different regional disease and poorerprognosis[J]. J Cancer, 2011, 2,538-543.
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5. 计划与进度安排1、第1周(2024年2月20日—2024年2月26日):根据和导师讨论确定的论文题目,阅读相关文献了解课题并完成绪论的大纲。 2、第2周(2024年2月27日--2024年3月3日):在充分调研文献的基础上,制定实验具体实施计划,进行前期准备工作。 3、第3周-第5周(2024年3月6日--2024年3月26日):根据任务内容实施试验,包括从GEPIA、UALCAN、人类蛋白质图谱、TIMER、KMPLOT数据库获取实验所需数据并进行分析。
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