1. 研究目的与意义
背景： CSN是细胞内高度保守的多亚基蛋白质复合物,主要定位于真核细胞的细胞核。CSN复合物作为蛋白泛素化降解系统中重要的调控蛋白，其功能的紊乱会导致多种疾病的发生。CSN复合物含有8个亚基，它是泛素蛋白酶体系中重要的调控蛋白，调控Cullin蛋白的deneddylation进而调控体内蛋白的降解，体内20%的蛋白降解由Cullin蛋白家族调控。体内蛋白降解失衡会导致肿瘤的发生发展，在细胞内CSN7亚基有两个亚型CSN7A和CSN7B，这两个亚型的复合物对肿瘤的发生发展目前研究较少，因此本课题主要探究CSN7复合物在肾癌中的作用机制。
目的：通过对生信数据库的分析，明确CSN7A和CSN7B在癌和癌旁组织的表达情况以及患者生存预后情况，探究CSN7A和CSN7B复合物对肾癌发生发展的作用机制。
意义：通过探究CSN7A和CSN7B复合物对肾癌发生发展的作用机制，方便之后对于这方面的研究，希望CSN7A和CSN7B能成为治疗肾癌的新靶点，促进CSN靶向药物的研究及开发。
2. 研究内容和预期目标
（1）通过GEPIA数据库，明确CSN复合物的不同亚型在不同癌种中的表达情况，明确CSN不同复合物在不同癌种中的表达差异，筛选出有明显差异的癌种进一步明确其作用机制。
（2）通过ULACAN数据库分析，明确CSN复合物的不同亚型在肿瘤不同时期，不同性别，不同人种以及不同年龄中的差别，确定CSN复合物的不同亚型在肾癌中的功能。
（3）通过人类蛋白质图谱免疫组化分析，明确CSN复合物的不同亚型在肾癌的癌组织和癌旁组织中的表达水平。
3. 研究的方法与步骤
1、GEPIA数据库
GEPIA官方网站:http://gepia.cancer-pku.cn index.html。该网站由北大张泽民教授团队开发。从架构上来讲,，GEPIA用MySQL创建数据库, 主题分析流程由R和PerL完成, 用php实现网页式交互展示。GEPIA提供了关键的交互式分析，包括肿瘤/正常差异表达谱分析、剖面绘制、根据肿瘤类型或病理分期进行分析、患者生存分析、相似基因检测、相关性分析和降维分析等分析模块,，同时还提供快速定制功能。基因表达通常由人体图和柱图点图来表示，人体基因表达图即在人体中肿瘤和正常样本的中位表达图；点图和柱图即所有肿瘤样本和配对正常组织的基因表达谱(点图:每个点代表样本的表达式；柱图:柱的高度代表某一肿瘤类型或正常组织的中位表达)。基因表达谱GEPIA生成多个癌症类型和成对的正常样本的基因表达谱点图，每个点代表一个不同的肿瘤或正常样本。
2、UALCAN数据库
4. 参考文献
[1]. Aubrey, B.J., Kelly, G.L., Janic, A., Herold, M.J., and Strasser, A. (2018). How does p53 induce apoptosis and how does this relate to p53-mediated tumour suppression? Cell Death Differ. 25, 104–113.
[2]. Bech-Otschir, D., Kraft, R., Huang, X., Henklein, P., Kapelari, B., Pollmann, C.,and Dubiel, W. (2001). COP9 signalosome-specific phosphorylation targets p53 to degradation by the ubiquitin system. EMBO J. 20, 1630–1639.
[3]. Berger, N.D., Stanley, F.K.T., Moore, S., and Goodarzi, A.A. (2017). ATMdependent pathways of chromatin remodelling and oxidative DNA damage responses. Philos. Trans. R. Soc. Lond. B Biol. Sci. 372, 20160283.
[4]. Brownell, J.E., Sintchak, M.D., Gavin, J.M., Liao, H., Bruzzese, F.J., Bump, N.J., Soucy, T.A., Milhollen, M.A., Yang, X., Burkhardt, A.L., et al. (2010). Substrate-assisted inhibition of ubiquitin-like protein-activating enzymes: the NEDD8 E1 inhibitor MLN4924 forms a NEDD8-AMP mimetic in situ. Mol. Cell 37, 102–111.
[5]. Cavadini, S., Fischer, E.S., Bunker, R.D., Potenza, A., Lingaraju, G.M., Goldie, K.N., Mohamed, W.I., Faty, M., Petzold, G., Beckwith, R.E., et al. (2016). Cullin-RING ubiquitin E3 ligase regulation by the COP9 signalosome. Nature 531, 598–603.
[6]. Chang, H.H.Y., Pannunzio, N.R., Adachi, N., and Lieber, M.R. (2017). Non-homologous DNA end joining and alternative pathways to double-strand break repair. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 18, 495–506.
5. 计划与进度安排
1、寒假：根据和导师讨论确定的论文题目，阅读相关文献了解课题并完成绪论的大纲。
2、第2周（2024年2月27日--2024年3月3日）：在充分调研文献的基础上，制定实验具体实施计划，进行前期准备工作；
3、第3周-第5周（2024年3月6日--2024年3月26日）：根据任务内容实施试验，包括从GEPIA、UALCAN、人类蛋白质图谱、TIMER、KMPLOT数据库获取实验所需数据并进行分析。
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