1. 研究目的与意义
加州鲈鱼，也叫大口黑鲈(Micropterus salmoides)是一种适应性强、生长快、肉质嫩等优点的优质淡水鱼。这种淡水鱼原产于北美，被认为是世界上最受欢迎的淡水鱼。由于该鱼种的诸多优点，在中国被广泛养殖，也成为水产养殖中具有重要价值的鱼类。随着养殖规模和密度的扩大，由真菌、细菌、寄生虫和病毒等不同病原体引起的疾病已成为严重威胁大口黑鲈养殖的重要因素。在这些病原体中，由于疫苗的缺乏，大口黑鲈病毒性疾病是对大口黑鲈养殖的最大威胁。
目前，已有在大口黑鲈中发现多株具有高致病性和死亡率的病毒，如大口黑鲈病毒(LMBV)、大口黑鲈溃疡综合征病毒(LBUSV)、大口黑鲈弹状病毒(MSRV)[5]、双RNA病毒、传染性脾肾坏死病毒(ISKNV)、鱼呼肠孤病毒(PRV)、神经坏死病毒(NNV)、鲤鱼春季病毒血症病毒(SVCV)和病毒性出血性败血症病毒(VHSV)和彩虹病毒（Iridoviridae）等。这些病毒给大口黑鲈的养殖带来了巨大的经济损失。
近年来，随着海洋微生物研究的不断深入，越来越多的病毒被发现并且对宿主生态系统的影响也越来越受到关注。而针对加州鲈鱼体内的潜伏性感染性病毒的系统调查研究却相对较少，因此有必要对加州鲈鱼体内的新型病毒进行系统性挖掘。
2. 研究内容和预期目标
研究目标：利用宏病毒组学技术探索加州鲈鱼体内潜在的感染性病毒。
研究内容：
（1）组织病毒核酸的提取：收集加州鲈鱼（肝脏、肾脏和胰脏）组织，提取病毒核酸，并进行纯化和富集。
3. 研究的方法与步骤
研究旨在通过病毒宏基因组学的方法，分析加州鲈鱼体内的病毒种类及其数量，并对其中的新型病毒进行进一步鉴定和分类。
具体实验设计如下：
（1）样品采集：收集加州鲈鱼样品，包括肝脏、鳃等组织以及血液等样品。
4. 参考文献
[1] Kong C, Liu G, Kalady MF, Jin T, Ma Y. Dysbiosis of the stool DNA and RNA virome in Crohns disease. J Med Virol. 2023 Feb;95(2):e28573. doi: 10.1002/jmv.28573. PMID: 36772850.
[2] Lee BD, Neri U, Roux S, Wolf YI, Camargo AP, Krupovic M; RNA Virus Discovery Consortium; Simmonds P, Kyrpides N, Gophna U, Dolja VV, Koonin EV. Mining metatranscriptomes reveals a vast world of viroid-like circular RNAs. Cell. 2023 Feb 2;186(3):646-661.e4. doi: 10.1016/j.cell.2022.12.039. Epub 2023 Jan 24. PMID: 36696902; PMCID: PMC9911046.
[3] Neri U, Wolf YI, Roux S, Camargo AP, Lee B, Kazlauskas D, Chen IM, Ivanova N, Zeigler Allen L, Paez-Espino D, Bryant DA, Bhaya D; RNA Virus Discovery Consortium; Krupovic M, Dolja VV, Kyrpides NC, Koonin EV, Gophna U. Expansion of the global RNA virome reveals diverse clades of bacteriophages. Cell. 2022 Oct 13;185(21):4023-4037.e18. doi: 10.1016/j.cell.2022.08.023. Epub 2022 Sep 28. PMID: 36174579.
5. 计划与进度安排
（1）2024-2024-1学期第17周~2024-2024-2学期第1周（2024.12.19~2024.2.26）：查阅资料，准备开题报告，外文文献翻译；
（2）第2周~第4周（2024.2.27~3.19）：加州鲈鱼组织采集；
（3）第5周~第8周（2023.3.20~4.16）：学习生物信息学分析软件；
以上是毕业论文开题报告，课题毕业论文、任务书、外文翻译、程序设计、图纸设计等资料可联系客服协助查找。
