1. 研究目的与意义
胃癌（gastric carcinoma）是主要发生在胃黏膜上皮的恶性肿瘤,在全世界各个国家中，胃癌患者的发病率和死亡率都首屈一指，其发病原因与地区环境和个人生活习惯有较大关系。在地域上，我国西北和东部沿海地区胃癌发病率明显高于其他地区；饮食习惯上，长期食用亚硝酸盐、真菌毒素、多环芳烃化合物等致癌物或前致癌物含量高的熏烤、腌制食品的人群，发病率较高；而且吸烟与胃癌的发生相关，吸烟者发病危险较不吸烟者高50%[1]。其他因素，包括高龄、男性、家族病史等都是胃癌的危险因素。
幽门螺杆菌（Helicobacter pylori,H.pylori）是导致胃溃疡、胃炎等多种胃内疾病发生以及发展成胃癌的主要病原体，我国是H.pylori感染大国，有一半以上的国民存在H.pylori感染[2]。据世界卫生组织国际癌症研究机构（IARC)的数据统计结果表明，我国每年新发胃癌病例约为48万例，死亡病例约为37万例[3]，胃癌的全球死亡率仅次于肺癌和胃癌，占比为8.2%。近几年来，由于饮食结构改变，工作压力增大，胃癌呈现年轻化倾向[4],在胃癌发病趋势缓步下降的背景下，35岁下的青年发病趋势却在上升。
胃癌对人体伤害非常大。早期患者多数为无症状，少数人可能会出现恶心、呕吐等症状。随着癌细胞的扩散和转移，通常会有上腹疼痛、食欲下降、乏力等症状。到了胃癌晚期，患者常可出现贫血、消瘦、营养不良甚至恶病质等表现。因为胃癌早期无症状或症状模糊不明显，导致患者往往未能及时就医治疗，而早期胃癌的检出率非常低，在胃镜下没有明显特征，病灶小，易被忽略。
2. 研究内容和预期目标
本课题通过分析GEO数据库中胃癌患者相关的基因表达谱和临床信息数据，通过一系列的生物信息学方法建立胃癌预后风险预测模型并预测潜在的药物靶点。首先，通过差异表达分析和hub gene筛选确定胃癌中具有预后价值的基因，其次，进行功能富集分析，以探讨该预后风险相关基因潜在的生物学机制。同时，还利用蛋白质互作网络分析，鉴定出与胃癌相关的差异表达显著的关键基因。接着，利用基因表达谱数据库，根据差异表达基因在参考基因表达谱中的富集情况，得到其与各种药物的相关性分数以及作用机制，进而筛选出与胃癌相关的药物，最后，利用分子对接工具，根据靶蛋白与候选药物的对接结果的结合能的相对值，筛选出合适的药物靶点。
因此，本研究通过构建胃癌预后风险预测模型并进行药物靶点分析，对胃癌患者的总体生存时间进行评估，以期开发新的多基因风险预测模型，为高危胃癌患者的识别提供有价值的信息，同时预测潜在的药物靶点，为胃癌患者的预后预测和临床治疗提供参考。
3. 研究的方法与步骤
1、数据收集和差异表达基因的筛选
从GEO数据库中下载GSE79973、GSE118916、GSE65801的基因表达谱和临床信息数据。利用GEO便捷转换器导出三组数据分别对应的样本信息和数据矩阵，将三组数据按正常样本和肿瘤样本分类，利用limma包读取标准化处理后的数据，得出差异表达基因的统计分析结果，并以|log2(FC)| ≥1且adj.P.Val＜0.05为标准，筛选出差异表达显著的基因。
2、差异表达显著基因交集的获得
4. 参考文献
[1].郭建,王方志.中国大陆地区吸烟与胃癌关系:基于配对病例对照研究的Meta分析[J].沈阳医学院学报,2017,19(04):306-309.
[2.]许鑫博,何丛,祝荫.幽门螺杆菌与胃癌防治的新进展[J].上海医学,2022,45(11):791-794.
[3].Sung H,Ferlay J,Siegel RL,et al. Global Cancer Statistics 2020: GLOBOCAN Estimates of Incidence and Mortality Worldwide for 36 Cancers in 185 Countries[J]. CA Cancer J Clin,2021,71(3):209-249.
5. 计划与进度安排
1、寒假：根据和导师讨论确定的论文题目，大量阅读文献，其中选择10篇以上参考文献（外文1-2篇或以上）进行深入阅读，参照任务书写出开题报告。选择一篇外文（5000字以上，文献内容要结合本研究内容）进行全文翻译。
2、第2周（2023年2月27日--2023年3月3日）：在充分调研文献的基础上，制定实验具体实施计划，进行试验研究的前期准备工作；
3、第3周-第5周（2023年3月6日--2023年3月25日）：根据任务内容实施试验，包括鉴定胃癌癌症和癌旁组织的差异表达基因，构建胃癌预后风险模型，预测胃癌的药物靶点等；
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