二花脸猪INHA基因3UTR与5UTR区域SNP的鉴定及其与产仔数关联的研究开题报告

 2023-02-14 01:45:10

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

(1)课题意义

产仔数的高低直接影响养猪生产经济效益,解析产仔数变异的遗传机理具有重要理论和应用价值。二花脸是产仔性能极其优秀的地方品种,但长期观察发现品种内产仔数分离明显。产仔数是一个复杂的性状,受到排卵率、胚胎/胎儿存活率、子宫容积等诸多因素的影响。指导教师的实验室通过获得二花脸猪原始测序序列(Sequenced Reads)后,参考猪的基因组序列,对所获得的序列进行生物信息学分析,找到显著影响二花脸猪品种内产仔数的差异基因,发现INHA基因的存在。已知INHA基因参与卵母细胞的生长、实现卵母细胞的发育潜能等卵子发生过程中的关键步骤,于是着重选取这个基因研究其变异位点。,本试验拟利用PCR反应与DNA测序技术,分析该位点基因型与302头二花脸母猪窝产仔数的相关性,以验证该位点的效应。本试验将为解析产仔数变异分子机理提供部分理论依据,为选育二花脸地方品种稳定高产群体提供关键分子标记。

(2)国内外研究进展

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2. 研究的基本内容和问题

(1)研究目标

1)检测INHA基因产生的SNP位点在302头二花脸母猪内的基因型。

2)分析这些SNP位点不同基因型与窝产仔数的关联性。

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3. 研究的方法与方案

(1)研究方法

采用实验室检测与动物试验相结合的方法开展相关试验研究。

(2)技术路线

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4. 研究创新点

特色或创新之处

以二花脸猪为研究对象,鉴别并验证INHA 3 5窝产仔数相关SNP在302头母猪的群体内的效应,进行基因型与产仔数的关联分析,试验结果将为解析产仔数变异分子机理提供部分理论依据,为选育二花脸地方品种稳定高产群体提供关键分子标记。

5. 研究计划与进展

研究计划及预期进展

2016年8月--10月:采集具有准确窝产总仔数记录的302头纯种二花脸母猪的耳组织样品;

2016年11月--12月:利用传统酚/氯仿法提取耳组织基因组DNA,经过质量、浓度检测后将浓度稀释到30ng/μL于-20℃下保存备用;

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