1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）
研究意义：
干扰素-γ（interferon-gamma, IFN-γ）是T淋巴细胞和自然杀伤性细胞（NK）产生的多功能细胞因子。干扰素-γ不仅具有抗病毒功效，并且可以通过它的免疫调节活动来调节免疫应答，间接调节肿瘤细胞分化，刺激主要组织相容复合体（MHC）分子的表达，激活单核巨噬细胞，对正常的肿瘤细胞增殖有影响，还可以控制B淋巴细胞分泌免疫球蛋白[1]。现代化的养猪生产，生产性状与抗性性状之间存在着一定程度的遗传拮抗，表现为负遗传相关，单纯追求高产通常会导致猪自身抵抗性降低，同时猪场疾病，特别是病毒性传染病严重威胁猪的健康。尽管免疫接种发挥了重要的防治作用，但始终未能完全控制和消灭传染病的流行[2]。从长远来看，采用分子遗传学方法从遗传本质上提高猪自身对病原体的抵抗力是另一条有效的解决途径。因此，本实验以猪IFN-γ基因作为免疫抗性相关的候选基因进行研究，探索其在免疫应答机制中的关键作用，筛选出与免疫性状相关的分子遗传标记，应用于标记辅助选择，对培育具有抗性的猪新品系具有十分重要的科学意义。
国内外研究概况：
2. 研究的基本内容和问题
研究目标：
在大白猪和长白猪免疫应答RNA测序结果的基础上，选取猪IFN-γ基因作为抗性相关的候选基因，进一步寻找和鉴定IFN-γ基因中的SNP位点，并与猪相关免疫性状做相关分析，验证IFN-γ基因在免疫应答抗性的重要影响及作用。
研究内容：
3. 研究的方法与方案
研究方法：
本实验基于RNA-seq测序结果和数据处理与分析等技术，筛选出差异表达基因，在差异表达基因的结果中选出效应显著的候选基因IFN-γ基因。对IFN-γ基因外显子区域进行PCR扩增，得到大白猪和长白猪两猪种的IFN-γ基因全部外显子片段，利用PCR产物直接测序，获得基因序列，并对比筛查到IFN-γ基因的功能SNP位点，利用PCR产物直接测序技术对猪资源群体进行SNP基因分型，统计分析其与免疫性状的相关。
技术路线及实验方案：
4. 研究创新点
特色或创新之处：通过对IFN-γ基因的功能SNP位点的筛查与鉴定，从而了解IFN-γ基因的抗性相关作用，为进一步标记辅助选择培育具有抗性的猪新品系提供理论依据和科学参考。
5. 研究计划与进展
研究计划及预期进展：
2016.10～2016.12：差异表达基因筛选、文献综述的提交、引物设计与合成。
2017.02～2017.03：鉴定IFN-γ基因， PCR扩增、测序、寻找功能SNP位点、相关分析。
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