1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）
1.研究意义
干扰素是一类多功能的细胞因子,在抵抗病毒感染、抑制细胞增殖和免疫调控方面起着重要的作用[1]。根据序列同源性和细胞表面受体复合物功能的不同，干扰素主要分为I型（α, β, τ，ω), II型 (γ)和 III型 (λ)。猪干扰素调控因子5基因（Interferon regulatory factor 5，IRF5）是干扰素调控因子家族的成员之一。位于18号染色体20747732-20760161bp间的一段回文序列（ENSEMBLE Gene Id: ENSSSCG00000016573），基因组序列长约12.43kb。由503个氨基酸序列组成的转录因子，含有9个外显子和8个内含子（图1）。
2. 研究的基本内容和问题
1.研究目标
基于梅山猪和长白猪免疫应答表达基因mRNA测序结果的基础上，选取干扰素调控因子5作为猪抗性基因候选基因，进一步寻找和鉴定IRF5基因中的SNP突变位点，并与免疫性状做相关分析，验证其在免疫应答中的关键作用。
2.研究内容
3. 研究的方法与方案
1．研究方法
本实验基于RNA-seq测序结果和数据处理与分析等技术，筛选出差异表达基因，在差异表达基因结果中选出效应显著的候选基因IRF5。对IRF5基因外显子区域进行PCR扩增，得到大白猪和长白猪两个猪种的IRF5基因全部外显子片段，利用PCR产物直接测序，获得基因序列，并对比筛查到IRF5基因的功能SNP位点，利用PCR产物直接测序技术对猪资源群体进行SNP基因分型。最后与测定的相关免疫性状进行相关分析，揭示IRF5对相关免疫性状的影响。
2．技术路线
4. 研究创新点
通过对干扰素调控因子5基因的功能SNP位点的筛查与鉴定，从而研究干扰素调控因子5基因的抗性相关作用，为进一步标记辅助选择培育具有抗性的猪品系提供理论依据和科学参考。
5. 研究计划与进展
2016.04～2016.11：差异表达基因筛选、文献综述的提交、引物设计与合成;
2017.01～2017.03：鉴定IRF5基因，PCR扩增、测序、寻找功能SNP位点及相关分析;
2017.04～2017.05：数据、结果的整理，毕业论文的书写与完成、完成毕业答辩。
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